قسم الباطنية هو أحد الأقسام الرئيسية بكلية الطب ويقوم بتدريس المقررات التالية:

أمراض الباطنية، امراض الجهاز العصبي، الامراض الجلدية والطب النفسي لطلاب الطب ابتداءا من السنة الثانية والثالثة حيث يتم تدريس الأساسيات ضمن الوحدات التدريسية المختلفة ثم التطبيق السريري وتعليم المهارات السريرية ابتداءآ من السنة الرابعة وحتى السنة السادسة حيث تكون المادة التدريسية أكثر تفصيلا وعمقا حتى يتمكن الطالب المتخرج من التعامل مع حالات الأمراض المختلفة بكفاءة عالية. إضافة الى ذلك يشرف القسم على بعض المقررات التي تدرس بالسنوات السريرية مثل اخلاقيات الطب وسلامة المرضى ومقرر التخدير.